En la actualidad, la Junta del Hospital La María ejerce un control minucioso sobre los procesos asistenciales, financieros y de apoyo administrativo, sirviendo de soporte y apoyo permanente a la administración.
La Junta Directiva de la Empresa Social del Estado Hospital La María informó que solicitó a los órganos de control adelantar todas las investigaciones tendientes a esclarecer los hechos ocurridos alrededor de las denuncias realizadas por la Superintendencia Nacional de Salud referente a supuestas irregularidades en esta institución de salud. Por lo tanto, en octubre de año 2016, requirió al representante legal, William Marulanda Tobón, tomar como medida inicial aceptar su renuncia.
La Junta Directiva ordenó de manera clara y precisa, a todos los funcionarios responsables del manejo de la información o quienes sean requeridos "entregar toda la documentación solicitada por cualquier organismo de control del orden nacional o territorial".
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Además del riguroso control y de la aplicación de los correctivos necesarios "hoy nuestros esfuerzos están enfocados en convertir a La María en una institución moderna, con nueva infraestructura, bien dotada, que sea alternativa para los antioqueños y colombianos en temas como servicios para enfermedades prevalentes de la mujer. En este propósito contamos hoy con el apoyo incondicional de la Gobernación de Antioquia" y convocaron a los ciudadanos para que sean partícipes de la construcción de un Hospital con visión social.